Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLA1P09884 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLA1P09884 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLA1P09884 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLA1P09884 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLA1P09884 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms