Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms