Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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CTNSO60931 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNSO60931 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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