Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLIN3O60664 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms