Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX1O43812 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX1O43812 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX1O43812 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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