Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DENRO43583 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DENRO43583 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DENRO43583 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DENRO43583 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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