Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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HOXA3O43365 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HOXA3O43365 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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