Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms