Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF839A8K0R7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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