Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PIPSLA2A3N6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms