Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PCDHA12Q9UN75 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms