Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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