Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CPNE7Q9UBL6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CPNE7Q9UBL6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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