Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms