Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms