Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.6 ms