Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A8Q9C0K1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A8Q9C0K1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms