Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKD2Q9BZL6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms