Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCO2Q9BYV7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCO2Q9BYV7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms