Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CINPQ9BW66 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms