Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2AFJQ9BTM1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms