Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NICN1Q9BSH3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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