Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms