Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms