Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RNF185Q96GF1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms