Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NXNL1Q96CM4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NXNL1Q96CM4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms