Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COPS9Q8WXC6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms