Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDDC3Q8N4P3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDDC3Q8N4P3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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