Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms