Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB11FIP4Q86YS3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms