Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms