Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BHLHA9Q7RTU4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms