Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED27Q6P2C8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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