Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms