Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SPIN4Q56A73 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPIN4Q56A73 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms