Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFB133Q30KQ1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms