Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms