Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MICAQ29983 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MICAQ29983 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MICAQ29983 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms