Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATP6V1FQ16864 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATP6V1FQ16864 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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