Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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