Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB35Q15286 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms