Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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BRD3Q15059 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRD3Q15059 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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