Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARHGEF6Q15052 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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