Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLCA4Q14CN2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLCA4Q14CN2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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