Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms