Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms