Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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