Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASGRF1Q13972 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RASGRF1Q13972 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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