Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAPSQ13938 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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