Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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